Dies ist ein Museum, das ganz der Geschichte der Einwanderung in Amerika gewidmet ist, angefangen bei der Ankunft der ersten Einwanderer bis hin zum heutigen Tag.

Unter den verschiedenen Bereichen befindet sich einer mit dem Namen Through America's Gate, der Schritt für Schritt die Prozedur zeigt, die ein Einwanderer durchlaufen musste, um ein Einreisevisum zu erhalten.

Auf der Insel befindet sich eine Mauer, die American Immigrant Wall of Honor, auf der die Namen von über 500.000 Einwanderern verewigt sind, darunter auch der des Urgroßvaters von George Washington.

Millionen amerikanischer Bürger können ihre Wurzeln über das Museum von Ellis Island finden. In der zweiten Etage befindet sich der riesige Registry Room, wo noch die Pulte der Inspektoren zu sehen sind.